La Congrégation de l'OmbreLe Quartier général de la Congrégation se trouve en Europe du Nord. Komui Lee est le Supervieur en chef, il est chargé de gérer l'organisation, et s'occupe des exorcistes en l'absence des Maréchaux.
Le Superviseur commande aux différentes sections, (dont la section scientifique, la section de recherche, la section médicale...) et aux différentes branches (Asiatique, Moyen-Orient, Nord Américaine, Sud Américaine, Africaine et Australienne). La section la plus importante est la Section asiatique, avec à la tête, Bak Chan.
Les ExorcistesLes Exorcistes sont considérés comme les élus de Dieu. Appelés aussi « Prêtres Noirs ». Ils sont reconnaissables à leurs longs habits noirs et au crucifix cousu sur leur manteau, au niveau du cœur. Ils sont les soldats de la Congrégation de l'Ombre, répartis sous plusieurs unités.
Chacune des unités correspond à un Maréchal: Marian Cross, Froi Tiedoll (décédé), Winters Soccalo, Cloud Nine et Kevin Yeegar.
Ces Maréchaux sont eux mêmes sous l'ordre de Grands Maréchaux.
Les FindersCe sont des être humains normaux appartenant à la Congrégation de l'Ombre. Comme leur nom l'indique, ils sont chargés d'enquêter et de rechercher les fragments d'Innocence éparpillés dans le monde.
Ils disposent chacun d'une ligne téléphonique qui leur est propre, de telle sorte qu'ils puissent contacter au plus vite l'Organisation.
Malgré le fait qu'ils soient vulnérables aux attaques d'Akuma, ils disposent d'un talisman, une sorte d'appareil qui projète une aura, et qui paralyse les Akuma, mais ce n'est que durant un temps limité.